依据国务院批准的《全国水土保持规划纲要》，1994年水利部就对水土保持监测网络和信息系统建设工作进行了安排部署，开展调研和论证工作，编制了《全国水土保持监测系统建设规划》。在此基础上，完成了《全国水土保持监测系统建设可研报告书》，并上报国家发展和改革委员会。2002年7月，国家发展和改革委员会批复了《全国水土保持监测系统建设一期工程可行性研究报告书》，据此，水利部水土保持监测中心组织完成了一期工程初步设计。2003年11月，国家发展和改革委员会批复了一期工程初步设计概算。2004年3月，水利部批复了一期工程初步设计报告。

       全国水土保持监测网络和信息系统建设分两期实施，一期工程建设期为3年，二期为2年。一期工程主要建设水利部水土保持监测中心，长江和黄河两个流域机构监测中心站，以及山西、内蒙古、陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆、湖北、湖南、重庆、四川、云南和贵州等13个省级监测总站及其100个监测分站。二期工程主要建设其余5个流域机构监测中心站、18个省级监测总站及相应的75个监测分站。    

        全国水土保持监测网络和信息系统建设资金由中央与地方共同承担。水利部水土保持监测中心、流域机构监测中心站、西藏自治区监测总站及其分站，由中央投资建设；内蒙古、重庆、四川、贵州、云南、陕西、甘肃、青海、宁夏和新疆等10个省级监测总站及其监测分站，由中央和地方共同承担，中央投资80%，省级配套20%；其余各省级监测总站及其监测分站，中央投资50%，省级配套50%。